Научно-исследовательская работа в Институте организована по следующим основным научным направлениям:

1. Методология и теория управления государственными и муниципальными финансами. Рук. Н.В. Фадейкина;

2. Совершенствование механизмов государственного и муниципального регулирования экономики субъектов хозяйствования.
Рук. Н.В. Фадейкина;

3. Теория, методология и методическое обеспечение оценочной деятельности.
Рук. Н.В. Фадейкина;

4. Финансовые механизмы управления экономическими системами.
Рук. Н.В. Фадейкина, Т.А. Владимирова, В.Г. Соколов;

5. Совершенствование банковской деятельности.
Рук. Н.В. Фадейкина;

6. Управление инновационной и инвестиционной деятельностью.
Рук. Н.В. Фадейкина, Т.А. Владимирова, В.Г. Соколов;

7. Разработка и совершенствование стандартов бухгалтерского учета и аудита.
Рук. Н.В. Фадейкина;

8. Разработка научно-методического обеспечения учебного процесса.
Рук. Н.В. Фадейкина.

В СИФБД под руководством профессора Н.В. Фадейкиной разработана и реализуется концепция контроля качества образования, которая базируется на следующих основаниях: нормативно-правовой базе РФ; требованиях к минимуму содержания и уровню подготовки специалистов (на основе ГОС); системе диагностики качества образования, средств обработки и описания результатов диагностики; мониторинге качества образования; механизме подготовки, принятия и реализации управленческих решений по повышению качества образования.

Для подготовки специалистов и реализации программ послевузовского образования Институт располагает квалифицированным составом руководителей диссертационных работ. К научному руководству аспирантами привлечены доктора экон. наук, профессора – Н.В. Фадейкина, Т.А. Владимирова, М.М. Ефимкин, Р.М. Гусейнов В.В. Михайлов, Д.И. Свириденко, Э.Г. Скибицкий, В.Г. Соколов, Н.Т. Стрельцова, канд. экон. наук, доценты – И.В. Баранова, Л.А. Корниенко, С.Ю. Сидоренко. В институте работают 133 преподавателя, из них докторов наук - 25, кандидатов наук – 46. Активную методическую помощь оказывает Институт аспирантам и соискателям. Доктором экон. наук, профессором Ю.В. Рожковым подготовлено электронное пособие «Соискателю: пособие по написанию, защите диссертации и оформлению документов в ВАК».

Ученые Института проводят исследования по актуальным финансово-экономическим проблемам с использованием компьютерной техники, новых технологий по решению теоретических аспектов и методик интегрированных информационных систем в экономике, финансовых институтов и кредитных организаций.

Для эффективной организации научной работы жизненно необходимым условием является регулярный обмен результатами научной работы, мнениями не только с разработчиками научно-практических методик, но и с конечными их потребителями, то есть специалистами-практиками коммерческих банков, негосударственных финансовых институтов, а также со специалистами финансовых, бухгалтерских служб различных организаций. С этой целью Институт проводит как научно-практические и научно-методические конференции, так и научно-практические семинары, на которых рассматриваются и обсуждаются научные проблемы и их практическое решение по указанным выше направлениям исследований.